根據南都報：環保部環評司司長崔書紅介紹，目前傾向于區分兩類情況處理。

一是對2015年1月1日新《環保法》生效前，建設單位未依法報批建設項目環境影響報告書、報告表，或者未重新報批或者報請重新審核環境影響報告書、報告表，擅自開工建設的建設項目，根據“法不溯及既往”原則，依照原環境保護法和原環境影響評價法執行，應當限期補辦環境影響評價手續。

二是對2015年1月1日新《環保法》生效后，包括2016年9月1日新《環評法》生效后的“未批先建”項目，不再適用“限期補辦手續”。但是，建設單位在接受環保部門處罰后，主動補辦環境影響報告書、報告表報請環保部門審批的，環保部門應當受理。對符合環境影響評價審批要求的，依法作出審批決定；對不符合環境影響評價審批要求的，不予批準，并依法責令恢復原狀。

崔書紅還表示，環保部將在與相關方面溝通后印發文件予以規范。相關要求以正式印發的文件為準。

除了行業性的驗收規范外，十一后環保自主驗收主要參考的文件如下（明確了多種情況環保驗收通不過）：

1、兩高司法解釋

2、建設項目環境保護管理條例

3、水電等9個行業建設項目竣工環境保護驗收現場檢查及審查要點

4、關于規范建設單位自主開展建設項目竣工環境保護驗收的通知（征求意見稿）

5、《建設項目竣工環境保護驗收技術指南 污染影響類 （征求意見稿）》